Özellikle deniz akvaryumu suyu içine ilk girilen su vasıtasıyla bu maddeler giriş yapar. Fosfat değeri yüksek besin giriş düzeyleri ile belli bir oran kazanır. Yüksek yosun türlerinin beslendiği filtreler ve fosfat tutucu kimyasallar yardımı ile sistemden uzaklaştırılabilir. 0,06mg/lt değerinin üzerine çıkmaması gerekir.Ancak sıfır değerlerinde tutulması omurgasız canlılarda renk kaybına yol açar. Silikat ise, genellikle ilk kurulum suyu ile girer. Çeşme suyu kullanımı tavsiye edilmez. Buharlaşan suyu tamamlarken silikat içermemesine dikkat edilmelidir. Bunun için reverse osmose suyu kullanmak yerinde olacaktır. Yoksa istenmeyen cyano bakteri ve diyatom oluşumu gerçekleşir. 2-3mg/lt değerinin üzerine çıkmamalıdır.Aşırı oluşması durumunda piyasada satılan silikat toplayıcı kimyasallar kullanılabilir. Sağlıklı bir deniz akvaryumu suyu üzerinde olması gereken deniz akvaryumu pH değeri 8,3 civarı ve yoğun mercan bulunan akvaryumlarda sabah saatlerinde akşama göre daha düşük olabilir. Fotosentezin etkisiyle ancak akşam saatlerinde 8,3 değerine ulaşır. Akvaryumlarda ph düşme eğilimindedir. Bunun sebebi yeterince yapılmayan su değişimi,efektif,arızalı, çalışmayan ps ,değiştirilmeyen elyaf,akvaryumda biriken aşırı tortu sebep olabilir. Öncelikle sebebi bularak ortadan kaldırmalı. En son çare olarak piyasada satılan ph yükselticiler kullanılabilir.